Jean Zay : la bibliothèque HDF5

HDF signifie Hierarchical Data Format. Ce format a été développé par le NCSA (National Center for Supercomputing Applications) avant d'être repris par le HDF Group. Il vise à faciliter la manipulation de fichiers contenant de très grandes quantités de données en hiérarchisant ces données en arborescence.

Les versions HDF5 1.8.21 et HDF5 1.10.5 sont installées sur Jean Zay. Elles ont été compilées en séquentiel et parallèle avec IntelMPI ou OpenMPI.

HDF5 est accessible via la commande module (documentation relative à la commande "module").

$ module load hdf5/1.8.21

ou

$ module load hdf5/1.10.5

$ module load hdf5/1.8.21-mpi

ou

$ module load hdf5/1.10.5-mpi

$ module load hdf5/1.8.21-mpi-cuda

Pour plus d'information sur la bibliothèque HDF5 : http://www.hdfgroup.org/HDF5/