******************************************************************** Flash Info de l'IDRIS - n° 2014-13 (17/11/14) ******************************************************************** Au sommaire : Turing - Arrêt planifié de Turing du 24 au 28 novembre 2014 - Mise à jour du système - libhphidris - Parallel-netCDF - GROMACS Ada - Changement de version de l'environnement paralléle IBM - CRYSTAL - GROMACS - Parallel-netCDF Calendrier des formations * Turing - Ainsi qu'il vient de vous l'être annoncé, un arrêt de la machine Turing va être nécessaire pour permettre l'installation des deux cabinets supplémentaires qui vont étendre sa configuration par l'ajout de 32 000 nouveaux coeurs de calcul. Cet arrêt aura lieu la semaine du 24 au 28 novembre 2014, à partir du lundi 24 novembre vers 8 h jusqu'au vendredi 28 dans la journée, sous réserve que les opérations prévues se déroulent normalement. - Le système de la machine (driver) a été mis à jour le 4 novembre dernier. La version est maintenant la V1R2M2 au lieu de la V1R2M1. Pour profiter des améliorations et correctifs notamment au niveau de la bibliothèque MPI, il est conseillé de recompiler vos applications. - libhpcidris : la version 5.0 est disponible et est devenue la version par défaut le 30 octobre 2014. Cette nouvelle version ajoute la possibilité d'effectuer des mesures de performance sur Turing (MFLOP/s, débits mémoires, débits réseaux...). Plus d'information : http://www.idris.fr/turing/tools/libhpcidris.html - Parallel-netCDF : la version 1.5.0 deviendra la version par défaut le 18 novembre 2014 ; la version précédente 1.4.0 reste disponible grâce à la commande module. Plus d'information : http://www.idris.fr/turing/biblis/pnetcdf.html - GROMACS 5.0.1 et 5.0.2 sont disponibles. Rappel : les outils de pré/post traitement des fichiers d'entrée sont accessibles uniquement depuis Adapp (ou Ada si vous disposez d'un compte sur cette machine). Plus d'information : http://www.idris.fr/turing/logiciels/gromacs.html * Ada - L’environnement parallèle IBM basculera de la version PE 1.3.0.7 actuelle en PE 1.3.0.9 le 25/11/2014. Cela implique une nouvelle version de poe et de la bibliothèque MPI IBM. Cet environnement étant chargé dynamiquement à l'exécution, il est inutile de recompiler. Pour information, cette nouvelle version de PE réduit fortement la mémoire virtuelle requise par les binaires MPI comparé au PE 1.3.0.7 (problème signalé dans le Flash Info du 30 avril 2014 http://www.idris.fr/static/flash-info/flash-info-de-l-idris-48.html). Suite à la bascule, il ne sera donc plus nécessaire de positionner la variable MP_EUILIBPATH dans votre environnement d’exécution. Si besoin, vous pouvez contacter l'équipe support (au 01 69 35 85 55 ou par mail à [email protected]) qui vous fournira de plus amples informations. - CRYSTAL 14_v1.0.3 est disponible. Plus d'information : http://www.idris.fr/ada/logiciels/ada-crystal.html - GROMACS 5.0.1 et 5.0.2 sont disponibles. Plus d'information : http://www.idris.fr/ada/logiciels/ada-gromacs.html - Parallel-netCDF : la version 1.5.0 deviendra la version par défaut le 18 novembre 2014 ; la version précédente 1.4.0 reste disponible grâce à la commande module. Plus d'information : http://www.idris.fr/ada/biblis/ada-pnetcdf.html * Calendrier des formations Il est encore temps de vous inscrire aux prochaines sessions de formation organisées à l'IDRIS : - "Fortran Base" du 27 au 29 janvier 2015 - "MPI" du 2 au 5 février 2015 - "OpenMP" les 10 et 11 mars 2015 Pour consulter le catalogue et vous inscrire : https://cours.idris.fr Vous recevez cette lettre électronique car vous êtes un utilisateur des machines de l'IDRIS. Vous pouvez consulter ce numéro du Flash Info de l'IDRIS ainsi que les numéros précédents sur le site web de l'IDRIS : http://www.idris.fr/flash-info.html